Pracownia Analiz Mikromacierzy Wydziału Biologii UW oraz Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN powstała w ramach projektu: Rozbudowa Laboratorium Projektowania Molekularnego oraz Zastosowań Genomiki i Proteomiki w Centrum Doskonałości BioExploratorium. Projekt jest współfinansowany przez Europejski Fundusz Rozwoju Regionalnego.
Pracownia jest wyposażona w system GeneChip®Scanner 3000 Targeted Genotyping System firmy Affymetrix, który wykorzystuje wysokiej gęstości płytki zawierające sondy oligonukleotydowe umożliwiające (między innymi) przeprowadzanie globalnej analizy stanu aktywności transkrypcyjnej tysięcy, a nawet dziesiątków tysięcy genów jednocześnie lub analizę polimorfizmów pojedynczych nukelotydów (SNP – single nucleotide polymorphisms). Przykładowo, do analizy profilu ekspresji genów dostępne są gotowe mikromacierze dla ponad 25 gatunków, w tym człowieka, myszy, szczura, Arabidopsis i drożdży. Analiza na poziomie DNA przy pomocy posiadanego przez nas systemu umożliwia prowadzanie takich badań jak: badania nierównowagi sprzężeń (ang. linkage disequilibrium); kompleksowe badania związków SNPs z fenotypem (ang. whole-genome association studies) oraz analizę zmienności liczby kopii (CNV- copy number variation).
Pracownia Analiz Mikromacierzy jest laboratorium referencyjnym, a nasi pracownicy odbyli specjalistyczne szkolenia w zakresie analizy transkryptomu oraz analiz SNP.
Integralną część grupy stanowi Zespół Bioinformatyczny, który zajmuje się analizą otrzymanych wyników z wykorzystaniem publicznie dostępnego oprogramowania oraz programu „PARTEK” zalecanego przez firmę Affymetrix.
Pracownia Analiz Mikromacierzy zapewnia wykonanie Państwa projektów przy użyciu nowoczesnych i stale udoskonalanych metod.
